超聲內鏡是將內鏡探頭插入消化道內，直接觀察消化道內病變的一種檢查手段。通常可以檢查食管、胃、十二指腸、小腸、大腸等器官，明確被檢者是否患有疾病，或者觀察器官是否存在病變。

1、食管：可以檢查出食管炎、食管息肉、食管腫瘤等疾病，可幫助明確疾病類型，明確病變程度;

2、胃：可以檢查出慢性胃炎、胃潰瘍、胃息肉等疾病，明確疾病類型與病變程度，判斷治療方法;

3、十二指腸：可以檢查出十二指腸乳頭炎、十二指腸潰瘍等疾病，明確疾病類型與病變程度，判斷治療方法;

4、小腸：可以檢查出小腸炎、小腸息肉等疾病，明確疾病類型與病變程度，判斷治療方法;

5、大腸：可以檢查出大腸炎、大腸息肉等疾病，以及十二指腸球部潰瘍、局限性腸炎等治療方法，還可以輔助檢查出一些腫瘤，對此可進行早期診斷。

此外，超聲內鏡也可用于檢查肛門部位，明確是否有痔瘡、肛裂等疾病，以及是否存在肛周膿腫、肛瘺等現象。

一般情況下超聲內鏡操作簡單、便捷，對患者損傷較小，且檢查時無明顯不適感，較為常用。但如果存在幽門狹窄或者胃腸道氣體過多的情況下，一般不建議使用超聲內鏡檢查。另外，超聲內鏡也有一些局限性，比如對于胃食管反流病的診斷，由于超聲內鏡的局限性，可能會看不到胃黏膜的病變，容易漏診或誤診。