胎兒畸形超聲檢查的檢查時間，與檢查的項目有關。產前超聲檢查一般在孕20-24周，而中期產前超聲檢查通常在孕22-28周，晚期產前超聲檢查一般在孕28-36周。

1、孕20-24周：一般建議孕婦在20-24周進行胎兒畸形超聲檢查，因為此時胎兒的器官發育基本成熟，可以觀察到不同部位、不同器官的發育情況，可對21-三體綜合征、18-三體綜合征、13-三體綜合征，以及胎兒的心臟畸形進行篩查;

2、中期產前超聲檢查：中期產前超聲檢查通常在孕22-28周進行，可通過超聲檢查明確胎兒的基本結構，還可明確胎兒大小、羊水、胎盤等情況，可對胎兒畸形，如無腦兒、胸腹壁缺損、腎盂積水、腦積水、聯體兒等進行篩查;

3、晚期產前超聲檢查：晚期產前超聲檢查通常在孕36周以后進行，可通過超聲檢查明確胎兒的肺部發育情況、羊水量、胎盤功能等情況，可對胎兒畸形，如腦積水、脊柱裂、唇腭裂、腎盂積水，以及心臟畸形等進行篩查。

胎兒畸形超聲檢查能夠篩查出大部分的胎兒畸形，如無腦兒、胸腹壁缺損、腎盂積水、腦積水、聯體兒等。雖然產前超聲檢查能夠大致判斷畸形的類型，但是因為產前超聲檢查是一種影像學檢查，結果可能會受到檢查人員的影響，如機器存在問題、超聲操作不當等，可能會影響到最終的檢查結果。建議孕婦在進行產前超聲檢查時要保持輕松的心情，不要過于緊張，避免焦慮。