超聲內鏡檢查一般需要2-3分鐘，主要針對于胃腸道超聲檢查，檢查前需禁食4-6小時，檢查時可見內鏡下息肉呈扇形，光帶明顯。超聲內鏡引導下的病理學活檢可以提高診斷的準確率，在臨床中得到廣泛應用。

1、胃腸道病變：可以觀察到食管、胃、十二指腸、小腸、大腸等，以及胃息肉、胃癌、結腸癌等病變形態、大小、位置等，明確病變性質;

2、食管病變：可以觀察到食管壁的增厚、增粗，或者食管腔外壓迫等情況;

3、胃腸道病變：可以觀察到胃腸壁的凹陷改變，如胃竇炎、胃潰瘍、十二指腸潰瘍、胃癌等;

4、血管病變：觀察胃腸道血管有無擴張、畸形、出血、潰瘍等;

5、淋巴病變：可以觀察到淋巴結腫大，或者淋巴管炎等。

此外，超聲內鏡技術還可以用于胸腔積液、腹水、腹腔腫塊及瘺管等疾病的診斷，也可以用于介入治療，如球囊擴張、支架植入等。超聲內鏡技術是未來發展的重要技術，可以實現對胃腸道疾病的早期診斷、定位診斷及內鏡下治療，初步判斷病變性質及范圍，將超聲內鏡引導下的組織穿刺活檢技術應用于臨床，可以為臨床診斷提供可靠的依據，目前臨床上超聲內鏡已普遍應用于食管、胃、結直腸、肝臟、膽囊、胰腺等多個器官系統的疾病診療中。